ساختار تشکیلاتی موساد

این موسسه همچنین مسئول جنبش مخفی مهاجران یهودی برای خروج آنها از سوریه، ایران و اتیوپی و مهاجرت دادن آنها به اسرائیل می باشد. عوامل موساد در حال حاضر در کشورهایی که سابقاً کمونیست بودند، غرب و سازمان ملل متحد فعال هستند.
دفتر اصلی موساد در تل آویو است. این مؤسسه در دهه 80 بین 1500 تا 2000 نفر پرسنل داشت و برآوردهای اخیر حاکی از 1200 نفر کارمند می باشد. هویت مدیر موساد معمولاً جزو اسرار حکومتی تلقی می شود و یا حداقل اینکه در عموم و رسانه ها چیزی در باره وی مطرح نمی شود اما در ماه مارس سال 1996 دولت اسرائیل انتصاب ژنرال ارشد دانی یاقوم را به جای رئیس قبلی این مؤسسه یعنی شبتای شاویت که در اوایل سال 1996 استعفاء داده بود، اعلام کرد و در سپتامبر 2002 مئیر داگان به عنوان مدیر جدید موساد انتخاب شد.
 
موساد که در گذشته به عنوان مؤسسه هماهنگی و مؤسسه مرکزی اطلاعات و امنیت اسرائیل شناخته می شد، در اول آوریل سال 1951 تشکیل شد. موساد توسط نخست وزیر وقت رژیم صهیونیستی یعنی داوید بن گورین تاسیس شد که هدف آن را اینگونه اعلام کرد: «برای کشور ما که از ابتدای تاسیس تحت فشار دشمنانش قرار داشته است، اطلاعات به عنوان خط مقدم دفاع ضروری است و ما باید به خوبی بیاموزیم و بدانیم که در اطرافمان چه می گذرد».
موساد هشت بخش اصلی دارد با این وجود جزئیات سازمان داخلی آن همچنان مخفی باقی مانده است. بخش جمع آوری که بزرگترین بخش آن است و مسئولیت عملیات جاسوسی را برعهده دارد، دفاتری را در خارج اسرائیل تحت پوشش دیپلماتیک و غیررسمی تاسیس کرده است. این بخش شامل قسمت هایی است که هر یک مسئول نواحی ویژه جغرافیایی می باشند و هدایت مأموران فعال درآن نواحی را برعهده دارند. موساد از سال 2000 یک فعالیت تبلیغی گسترده را در جهت استخدام ماموران جدید جمع آوری خبر و اطلاعات آغاز کرد.
 
بخش همکاری و اقدام سیاسی:
فعالیت های سیاسی و همکاری با سرویس های اطلاعات خارجی کشورهای دوست اسرائیل و نیز کشورهایی که روابط دیپلماتیک عادی با اسرائیل ندارد را انجام می دهد. در دفاتر بزرگتر خود در کشورهایی مانند فرانسه، موساد دو کنترل کننده منطقه ای تحت پوشش کارکنان سفارت خود در پاریس دارد. یکی ازآنها برای بخش جمع آوری کار می کند و دیگری برای بخش همکاری و اقدام سیاسی.
 
بخش عملیات ویژه:
با عنوان متساوا ترورهای بسیار حساس، خرابکاری ها و اقدامات شبه نظامی دقیق و پروژه های جنگ روانی را انجام می دهد. این بخش مسئولیت ترور شخصیت های ویژه و نظامی فلسطینی را برعهده دارد.
 
بخش LAP:
مسئول اجرای جنگ روانی، تبلیغات و عملیات فریب می باشد که تهاجمات فرهنگی و اخبار دروغ نشر شده در مطبوعات جزو اقدامات این بخش است.
 
بخش تحقیقات:
مسئول تولید اطلاعات نظیر گزارش های روزانه، خلاصه وضعیت های هفتگی و گزارش های مشروع ماهانه. این بخش در قالب 15 بخش ویژه جغرافیایی یا دفاتر منطقه ای سازماندهی شده است که شامل ایالات متحده آمریکا، کانادا و اروپای غربی، آمریکای لاتین، کشورهای سابق اتحاد جماهیر شوروی، چین، آفریقا، مغرب (مراکش)، الجزایر، تونس، لیبی، عراق، اردن، سوریه، عربستان سعودی، امارات متحده عربی و ایران می باشد. یک بخش هسته ای نیز متمرکز بر موضوعات خاص و مرتبط با تسلیحات هسته ای تشکیل شده است. که معمولاً جزو سری ترین بخش ها است.
 
بخش تکنولوژی:
مسئول توسعه فناوری های پیشرفته برای پشتیبانی فنی ازعملیات موساد است. در آوریل 2001 موساد یک آگهی استخدام در رسانه های اسرائیلی درج کرد مبنی بر اینکه به تعدادی مهندس الکترونیک و متخصص کامپیوتر برای واحد تکنولوژی موساد نیاز دارد.
در سال 1996 در یک نشریه چاپ آمریکا مطلبی درج شد که بخش اطلاعات عملیات موساد ادعا کرده است بزرگترین ترورهای دنیا را 10 دقیقه قبل از وقوع شناسایی می کند، در حالی که قبلاً CIA فاش کرده بود این اقدامات را 8 دقیقه قبل از وقوع ترور شناسایی می کند.